Добрый день!
Когда Вы задаёте вопрос, не забывайте, пожалуйста, о правилах форума. Напомню: мы стремимся создать на нашем форуме доброжелательную атмосферу. Поэтому у нас принято здороваться, а также говорить "спасибо" и "пожалуйста". Уважительное отношение к форумчанам, экспертам и модераторам - требование
правил форума.ИП не обязаны вести бухгалтерский учет, а размер налогооблагаемой базы при ЕНВД никак не зависит от количества выполненных рейсов. Так что с точки зрения собственных проверок ИП при утрате актов ничего не угрожает. Ну разве что возникнут сомнения в обоснованности начисления зарплаты наемным работникам, но здесь, я думаю, все же важнее иметь в наличии табели учета рабочего времени и путевые листы.
Проблема в том, что ИП не сможет предоставить документы в случае возможных встречных проверок контрагентов, создав им тем самым дополнительные проблемы с подтверждением подлинности сделок (а транспортные расходы традиционно проверяют очень тщательно).
И еще у ИП на ЕНВД довольно часто возникают сложности с подсчетом и обоснованием суммы своих доходов и расходов (для начисления алиментов, к примеру). Когда есть в наличии соответствующие документы, большого труда это не представляет.
Поэтому я обычно рекомендую все же хранить ИП в течение нескольких лет все первичные документы, несмотря на применяемый ЕНВД.